Опубликована статья с участием школьниковК списку новостей

21.07.2016

23 июня, в журнале BMC Genomics была опубликована статья,
работа над которой началась на школе молекулярной и теоретической биологии
под руководством Ильи Воронцова в лаборатории Ивана Кулаковского в 2014 году.

Мы поздравляем всю команду с опубликованной статьей, которую можно полностью изучить по ссылке.

Иван Кулаковский подготовил популярное объяснение предмета статьи и актуальности исследования:

"Мутационные процессы в раковых клетках изучаются очень активно, в том числе,
чтобы понять механизмы возникновения лекарственной устойчивости.
Долгое время изучались мутации в кодирующих районах генома
(т.е. потенциально влияющие на структуру и функции белков), в
последние годы, с развитием технологий высокопроизводительного
секвенирования, появились полногеномные данные о мутагенезе, в том
числе, в некодирующих областях. Мутации в некодирующих областях генома
не оказывают прямого влияния на аминокислотную последовательность
транскрибируемого белка, но могут влиять на экспрессию гена. В
частности, мутации в регуляторных участках ДНК, узнаваемых белковыми
регуляторами транскрипции (факторами транскрипции), могут изменять
активность транскрипции конкретных генов.

В нашей работе мы исследовали миллионы соматических мутаций в
некодирующих областях генома. Выяснилось, что ряд специфических
паттернов, соответствующих сайтам узнавания факторов транскрипции,
систематически избегают мутаций в различных видах раковых клеток. В
частности, неожиданно мало мутаций накапливается в сайтах связывания
белков семейств FOX и HOX, которые более консервативны и в нормальных
клетках.

Знание транскрипционных регуляторов, чьи сайты избегают мутационных
изменений, может позволить точнее локализовать критические участки
генных сетей, принципиальных для выживания и развития раковых клеток.

Мы начали эту работу на школе 2014 года и довели до публикации к
моменту, когда бывшие школьники, Даша Николаева и Григорий Химуля, уже
стали студентами."